விஷ்ணுவுக்கு அர்ப்பணிக்கப்பட்ட இந்த கோயில் விஷ்ணுவின் 108 திவ்ய தலங்களில் ஒன்றாகக் கருதப்படுகிறது. அவர் இங்கு கூடல் அழகர் என்று வணங்கப்படுகிறார். சன்னதி கருங்கல் சுவரால் சூழப்பட்டுள்ளது. ஐந்து நிலை ராஜகோபுரம் நுழைவாயிலைக் குறிக்கிறது. மதுரை பயணத்தின் போது இந்த கோவிலுக்கு வருவது என்பது பயணத்திட்டத்தில் தவிர்க்க முடியாத பொருளாக கருதப்படுகிறது. 

முக்கிய தெய்வம் தவிர, கூடல் அழகரின் துணைவியான மதுரவல்லி தேவியின் சன்னதியும் அழகாக அமைந்து உள்ளது. கிருஷ்ணர், ராமர், லட்சுமி தேவி மற்றும் நாராயணர் போன்ற தெய்வங்களின் சிறிய சன்னதிகளையும் இங்கு காணலாம். கோவிலின் வரலாறு பாண்டியர்களின் ஆட்சிக் காலத்திலிருந்தே தொடங்குகிறது. விஜயநகர வம்சத்தின் ஆட்சியாளர்கள் மற்றும் மதுரை நாயக்க மன்னர்கள் பின்னர் கோயில் கட்டமைப்பிற்கு குறிப்பிடத்தக்க பங்களிப்பை வழங்கினர். பரிபாடல் மற்றும் சிலப்பதிகாரத்தில் கோயில் குறிப்பிடப்பட்டுள்ளது. 

இக்கோயிலில் புத்திசாலித்தனமான நுணுக்க கல்வெட்டுகள் உள்ளன, அவை கட்டுமானத்துறையில் கோயில் பெற்ற விற்பன்னக் கலைஞர்களை குறிக்கிறது. மாங்குடி மருதனின் மதுரைக் காஞ்சி, கலித்தொகை, பரிபாடல், சிலப்பதிகாரம் போன்ற இலக்கியங்களும் கோயிலைப் பற்றிக் குறிப்பிடுகின்றன. இக்கோயில் புராணக்கதைகள் நிறைந்தது. ஒரு புராணக்கதை இவ்வாறு சொல்கிறது. விஷ்ணுசித்தர், பன்னிரண்டு ஆழ்வார்களில் ஒருவர்; மாய துறவிகள் வேத நூல்களில் இருந்து மேற்கோள் காட்டுவது மற்றும் நாராயணனின் இறையாண்மை பற்றிய அவரது வாதங்களுக்காக அறியப்பட்டார். ஒருமுறை பாண்டிய மன்னனின் அரசவையில் தனது உறுதியான வாதங்களின் மூலம் இறைவனின் பெருமையைப் போற்றினார். அப்போது ஒரு அதிசயம் நடந்தது, அதைத் தொடர்ந்து அரசர் தலைமையில் வெற்றி ஊர்வலம் நடந்தது. ஸ்ரீ கூடல் அழகர் தோன்றி விஷ்ணுசித்தரை ஆசீர்வதித்ததாக நம்பப்படுகிறது, பின்னர் அவர் இறைவனின் புகழில் திருப்பல்லாண்டு பாடி மங்களாசாசனம் செய்தார்.